Wir sind das Universitätsklinikum Hamburg-Eppendorf (UKE) – und stehen für exzellente Kompetenz in Forschung, Lehre und der vollumfänglichen Gesundheitsversorgung in unseren Kliniken. Unsere rund 17.000 Mitarbeiter:innen streben jeden Tag aufs Neue danach, mit ihrem Beitrag die Welt ein bisschen gesünder zu machen.
Es ist unser Anspruch, eine der führenden Universitätskliniken zu sein – und gleichzeitig der beste Arbeitgeber unserer Branche. So glauben wir im UKE fest daran, dass erfolgreiches und erfüllendes Arbeiten im Einklang mit den persönlichen Bedürfnissen und individuellen Lebensentwürfen der Mitarbeitenden stehen sollte. Und so unterschiedlich diese sind, so vielfältig ist unser Angebot an individuellen Lösungen.
Willkommen im UKE.
Wissenschaftliche:r Angestellte:r Junior / Doktorand:in (all genders) Computational Pediatric Oncology - Forschungsinstitut Kinderkrebs-Zentrum
Das macht die Position aus
Am Forschungsinstitut Kinderkrebs-Zentrum am Universitätsklinikum Hamburg-Eppendorf ist in der Arbeitsgruppe Computational Pediatric Oncology (Leitung Prof. Dr. Michael Bockmayr) zum 01.11.2026 eine Stelle als wissenschaftliche:r Mitarbeiter:in (PhD-Student) zu besetzen. Ein späterer Eintritt ist prinzipiell denkbar. Eine Promotion ist möglich und wird aktiv unterstützt.
Die Stelle ist im Rahmen eines BMFTR-geförderten Juniorverbundprojekts zu besetzen, das in enger Kooperation mit der TU Berlin (Dr. Mina Jamshidi Idaji/Machine Learning Group) und der LMU München (Prof. Dr. Philipp Jurmeister/Computational and Molecular Pathology) durchgeführt wird. Im Mittelpunkt steht die Entwicklung neuartiger Methoden für das multimodale maschinelle Lernen in der computergestützten Diagnostik. Ziel ist die Integration histopathologischer, klinischer und molekularer Daten zur Optimierung KI-gestützter Entscheidungshilfen in der Onkologie.
Eine professionelle und individuelle Betreuung wird über den gesamten Zeitraum gewährleistet. Darüber hinaus erwartet Sie im Forschungsinstitut ein motiviertes und dynamisches Team aus Ärzt:innen, Naturwissenschaftler:innen, Bioinformatiker:innen, technischen Assistent:innen und Studierenden, die im Rahmen unterschiedlicher Projekte und Ansätze der Erforschung kindlicher Krebserkrankungen auf der Spur sind.
Ihre Aufgaben:
- Entwicklung und Evaluierung klinisch relevanter multimodaler Klassifikationsalgorithmen mit Methoden des maschinellen Lernens auf Basis von Bilddaten und hochdimensionalen Omics-Datensätzen
- Integration von histologischen, molekularen (Genomik, Epigenomik, Transkriptomik auf Bulk- und Einzelzellebene) und klinischen Daten
- Enge Zusammenarbeit mit den Kooperationspartner:innen und weiteren Forschungsgruppen am Kinderkrebszentrum
- Präsentation der Forschungsergebnisse auf internationalen Konferenzen und Veröffentlichung als Erstautor:in in anerkannten Fachzeitschriften
Die Position ist drittmittel- und projektbedingt auf drei Jahre befristet.
Darauf freuen wir uns
- Abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium im Bereich Maschinelles Lernen, Bioinformatik, Informatik, Data Science, Angewandte Mathematik, Physik, Biomedical Engineering oder einem anderen relevanten Studiengang
- Nachgewiesene Programmiererfahrung in Python, gute Kenntnisse von ML-Frameworks wie PyTorch oder TensorFlow. Programmierkenntnisse in R sind vorteilhaft.
- Fundierte Kenntnisse aktueller Methoden des maschinellen Lernens
- Ausgezeichnete Kommunikationsfähigkeit und Fähigkeit zur interdisziplinären Zusammenarbeit
- Sichere Englischkenntnisse in Wort und Schrift, Deutschkenntnisse sind vorteilhaft
- Vorerfahrungen mit Representation-Learning, Transformer-Architekturen und erklärbarer KI (xAI) sind vorteilhaft
- Kenntnisse zur Verarbeitung von Omics-Daten und grundlegenden Methoden der Molekularbiologie sind vorteilhaft, aber nicht erforderlich. Für uns zählen vor allem Ihre fundierten Programmier- und ML-Kenntnisse
- Kenntnisse im Umgang mit UNIX-basierten Betriebssystemen und Versionskontrollsoftware sind wünschenswert
Wir freuen uns auf eine aussagekräftige Bewerbung inkl. Motivationsschreiben, CV, Referenzen, Abschlusszeugnissen, Liste der besuchten Lehrveranstaltungen sowie ggf. Verlinkung von Code-Beispielen, Abschlussarbeiten oder Publikationen.
Immunitätsstatus
Eine Einstellung ist nur möglich, wenn nach den jeweils geltenden (gesetzlichen und medizinischen) Vorgaben gegen das Masernvirus ein vollständiger Immunisierungs- bzw. Immunitätsnachweis vorliegt. Dies ist vor Beschäftigungsbeginn durch entsprechende Unterlagen (z. B. Impfausweis) nachzuweisen.
Das bieten wir
- Faire und transparente Vergütung nach unserem Tarifvertrag TVöD/VKA (63.600 € - 91.100 €) unter Berücksichtigung von Qualifikationen und Berufserfahrung. Die Gehaltsangabe bezieht sich auf eine Vollzeitstelle mit 38,5 Wochenstunden. Die genannten Beträge sind Richtwerte und stellen kein Gehaltsversprechen dar.
- Gezielte und individuelle Weiterentwicklung auf Fach- und Projektebene ist gegeben, so bieten wir eine langfristige Perspektive in einem sinnstiftenden Umfeld
- Umfangreiche Fort- und Weiterbildungsprogramme an unserer UKE-Akademie für Bildung und Karriere
- Möglichkeiten zur Mitgestaltung unserer Personalpolitik „UKE INside“ in berufsgruppen- und hierarchieübergreifenden Projekten
- Nachhaltig unterwegs: Zuschüsse zum Deutschlandticket als Jobticket und Dr. Bike Fahrradservice
- Ausgezeichnete Gesundheits-, Präventions- und Sportangebote
- Familienfreundliches Arbeitsumfeld: Kooperation zur Kinderbetreuung, kostenlose Ferienbetreuung, Beratung für Beschäftigte mit pflegebedürftigen Angehörigen
- Krisensicherer Arbeitsplatz, sinnstiftende Tätigkeit, wertschätzendes Miteinander
- Strukturierte Einarbeitung und offener Wissensaustausch im Team
- Unser Mitarbeitenden Restaurant bietet eine reiche Auswahl an kulinarischen Angeboten; weitere Angebote gibt es in den „Health Kitchen“ Cafés und Bistros und in einem Supermarkt direkt auf dem Gelände
